我想计算[BIm][Tf2N](结构见图1)这种离子液体的pKa值,主要关注图1中红圈所标注的H,我拟定了如下的计算步骤:下面的说明[BIm][Tf2N]以AH表示,[BIm][Tf2N]解离H以后的结构(见图2)以A-表示
1、采用smd模型,溶剂为水,优化AH、A-的结构,并确定无虚频,关键词: opt freq b3lyp/6-31G* scrf(smd,solvent=water) empiricaldispersion=gd3;
2、取1中优化得到的结构做气相下的频率分析,来获得AH、A-气相下的自由能(Ggas(AH)、Ggas(A-))以及单点能(Egas(AH)、Egas(A-)),关键词:freq m052x/6-31G* empiricaldispersion=gd3 ;
3、取1中优化得到的结构,用smd模型,溶剂为水计算AH、A-气相下的单点能Esol(AH)、Esol(A-),关键词:m052x/6-31G* scrf(smd,solvent=water) empiricaldispersion=gd3 ;
4、deltaG(AH)=Esol(AH)-Egas(AH), deltaG(A-)=Esol(A-)-Egas(A-), Ggas(H+)=-6.28 kcal/mol, deltaGsol(H+)=-265.9 kcal/mol, deltaG(1atm->1M)=1.89 kcal/mol;
5、deltaGsol=Ggas(A-)+Ggas(H+)-Ggas(AH)+deltaG(A-)+deltaGsol(H+)-deltaG(AH)+deltaG(1atm->1M);
6、pKa=deltaGsol/RT;
请问:
(1) 这整个计算流程是否可行?
(2) 第2、3步的计算都是在第1步的结构上进行,这样是否可以?
(3) 第2步进行频率计算的时候可能会出现虚频的情况,那么这一步计算出来的自由能是否可用?
(4) 每一步的方法/基组组合是否合理?有没有更好的方法/基组组合推荐?
谢谢。
![[BIm][Tf2N]的结构解离H以后的结构](http://www.ilsbbs.com/wp-content/uploads/hm_bbpui/274/wo8iuiwstu0m12cj91ot4f6d0kpb8bvu.jpg)